Câu lạc bộ thể thao được thành lập vào năm 1908. Hoạt động bóng đá không chính thức bắt đầu vào năm 1910, và đội bóng đá được thành lập vào năm 1913.

Vào tháng 2 năm 2009, câu lạc bộ đã gây chú ý trên toàn quốc bằng cách thuê huấn luyện viên 70 tuổi của UEFA Cup, Luigi Simoni làm giám đốc kỹ thuật (do giới hạn độ tuổi), với cựu huấn luyện viên đội U-19 Riccardo Tumiatti được thăng chức làm huấn luyện viên đội một.[1] Trong mùa giải 2010-11 Lega Pro Prima Divisione, câu lạc bộ đã giành được thăng hạng lên Serie B sau 63 năm, dưới sự dẫn dắt của Vincenzo Torrente (do chính Simoni bổ nhiệm). Tuy nhiên, việc Gubbio ở lại giải hạng hai của bóng đá Ý chỉ kéo dài một mùa giải khi họ ngay lập tức bị xuống hạng trở lại Lega Pro Prima Divisione.